• 大学院アジア・アフリカ地域研究研究科
• 東南アジア地域研究専攻連環地域論講座
• 東南アジア研究所
• 地域研究統合情報センター
• 研究科附属イスラーム地域研究センター（KIAS）
• 研究科附属現代インド研究センター（INDAS）
• 京都大学アフリカ地域研究資料センター

• 若手研究者インターナショナル・トレーニング・プログラム（ITP）
• グローバルCOEプログラム　生存基盤持続型の発展を目指す地域研究拠点
• 頭脳循環を活性化する若手研究者海外派遣プログラム
• 大学院教育改革支援プログラム　研究と実務を架橋するフィールドスクール（2008-2011）
• 21世紀COE - 世界を先導する総合的地域研究拠点の形成（2002-2007）
• COE - アジア・アフリカにおける地域編成 - 原型・変容・転成 - （1998-2003）
• 「魅力ある大学院教育」イニシアティブ：臨地教育研究による実践的地域研究者の養成（2006-2008）

• NIHUプログラム「イスラーム地域研究」
• 　　 NIHUプログラム「イスラーム地域研究」早稲田大学拠点（WIAS）
• 　　 NIHUプログラム「イスラーム地域研究」東京大学拠点（TIAS）
• 　　 NIHUプログラム「イスラーム地域研究」上智大学拠点（SIAS）
• 　　 NIHUプログラム「イスラーム地域研究」東洋文庫拠点（TBIAS）
• 　　 NIHUプログラム「イスラーム地域研究」京都大学拠点（KIAS）
• 共同利用・共同研究拠点「イスラーム地域研究拠点」
• 　　 共同利用・共同研究拠点「イスラーム地域研究拠点」東京大学拠点
• 　　 共同利用・共同研究拠点「イスラーム地域研究拠点」東洋文庫拠点
• 　　 共同利用・共同研究拠点「イスラーム地域研究拠点」京都大学拠点